嬰兒發作的癲癇的嚴重程度從自限性癲癇到更大的發育性和癲癇性腦病。嬰兒發病的發病率為1200分之一。發育和癲癇性腦病患者具有耐藥性癲癇發作、嚴重的發育障礙和高死亡風險，對家庭具有重要的心理社會影響，並對衛生係統造成重大經濟成本。

        嬰兒發作的癲癇通常具有遺傳病因(涉及>800個基因)。包括係統回顧在內的許多研究4顯示，在早期發病癲癲中基因麵板和外組測序具有很高的診斷產量和成本效益，基因測試現在被認為是一線調查。基因組測序進一步提高了診斷產量，但尚未在未選定的嬰兒癲癇隊列中進行研究。在罕見疾病中，基因組測序，特別是三重基因組測序，已經證明了可觀的診斷產量。

        對於患有癲癇的嬰兒，確定準確的診斷可以指導臨床管理，並為有關癲癇控製、發育結果和潛在合並症的預後提供信息。越來越多的遺傳癲癇具有精確治療意義，包括四個常見的嬰兒癲癇基因(KCNQ2、PRRT2、SCN1A、SLC2A1)。

        盡管目前大多數癲癲癇患者無法獲得遺傳療法，但定製抗癲藥物通常是可能的。此外，遺傳診斷可以告知臨床試驗或非抗癲藥物治療(如癲癇手術)的資格，並實現精確的遺傳谘詢。在關於非基因組測序基因測試對癲癇的影響的幾項研究中，遺傳診斷影響了36-72%的病例的管理。雖然快速基因測試和及時實施個性化治療(如果有的話)可能會改善結果，但一個主要挑戰是，測試通常需要數月到數年時間，嬰兒因不受控製的癲癇發作或潛在疾病而患有漸進的神經鼻癇。在新生兒重症監護室(NICU)和兒科重症監護病房(PICU)進行的研究表明，在一係列條件下快速(即周)和超快(即天)基因組測序具有高診斷率，具有臨床效用和醫療保健成本的降低。

        迄今為止，快速基因組測序主要在ICU進行，以及及時遺傳診斷對嬰兒的影響癲癇尚未確定。因此，2023年10月17日發表在Lancet Neurol的研究，旨在證明快速基因組測序的可行性，並研究新發性癲癇嬰兒的診斷產量和臨床效用。

        研究人員進行了一項國際多中心隊列研究(Gene-STEPS)，這是國際精準兒童健康夥伴關係(IPCHiP)的試點研究。IPCHiP是一個由四個兒科中心組成的財團，在澳大利亞、加拿大、英國和美國提供三級亞專業服務。我們從IPHiP中心招募了患有新發性癲癇或複雜發熱性癲癇發作的嬰兒，他們在癲癇發作時不到12個月。本文排除了有簡單發熱性癲癇、急性誘發性癲癇發作、已知後天性原因或已知遺傳原因的嬰兒。

        從探親和可用的親生父母那裏收集了血液樣本。從醫療記錄、治療臨床醫生和父母那裏收集了臨床數據。當父母雙方都可用時，三重基因組測序，當父母一方或父母雙方都可用時，進行雙重或單例基因組測序。特定地點的協議用於DNA提取和圖書館製備。在臨床認可的實驗室進行了快速基因組測序和分析，結果已返回給家庭。我們分析了隊列人口和臨床特征的彙總統計數據，以及快速基因組測序的時間、診斷產量和臨床影響。

        研究結果顯示，2021年9月1日至2022年8月31日期間，招收了100名新發癲癇的嬰兒，其中41名(41%)為女孩，59(59%)為男孩。癲癇發作的平均年齡為128天(IQR 46-192)。對於100名嬰兒中的43個(43%[二項分布95%CI 33-53])，本文確定了遺傳診斷，從癲癇發作到快速基因組測序結果的中位時間為37天(IQR 25-59)。

        遺傳診斷與新生兒癲癇發作與嬰兒癲癇發作(19例中的14 [74%]對81例中的29 [36%];p=0.0027)，轉診設置(12 [71%]，43名非重症監護住院病人中的19 [44%]，40名門診病人中的12 [30%];p=0.0178);以及癲癲綜合征(15名自閉症患者(15 [87%]，發育和癲癲癇病51例中的18 [35%]，其他綜合征的12 [35%];p=0.001)。

        快速基因組測序揭示了遺傳異質性，涉及34個獨特的基因或基因組區域。遺傳診斷具有立竿見影的臨床效用，為治療提供信息(43個中的24[56%])、額外的評估(28[65%])、預後(37[86%])和複發風險谘詢(所有病例)。

        綜上所述，這項國際多中心基因-STEPS研究是首次主要在重症監護環境之外和疾病特異性隊列中進行快速基因組測試的研究。本文證明了在多個三級兒科係統中新發性癲癇患者嬰兒快速基因組測序的可行性，具有高診斷率和臨床效果。本文發現為促使使用最先進的快速基因組測試提供了支持，以促進早期病因診斷，從而為這一弱勢群體的緊急定向管理提供信息。

        原始出處

        D'Gama, A. M., Mulhern, S., Sheidley, B. R., Boodhoo, F., Buts, S., Chandler, N. J., ... & McTague, A. (2023). Evaluation of the feasibility, diagnostic yield, and clinical utility of rapid genome sequencing in infantile epilepsy (Gene-STEPS): an international, multicentre, pilot cohort study. The Lancet Neurology, 22(9), 812-825.