骨科

lncRNA和mRNA在成骨細胞分化過程中的差異表達分析

作者:伊文 來源:MedSci梅斯 日期:2018-05-20
導讀

         長鏈非編碼RNA(lncRNA)正在成為影響代謝組織發育、信號傳導和功能的重要控製因子。然而,關於lncRNA在小鼠成骨細胞分化中的功能和概況知之甚少。本研究中,研究人員分析了從新生小鼠顱骨前成骨細胞樣細胞以兩天為間隔獲得的18天的RNA測序(RNA-Seq)數據集。

關鍵字:  成骨細胞 

        長鏈非編碼RNA(lncRNA)正在成為影響代謝組織發育、信號傳導和功能的重要控製因子。然而,關於lncRNA在小鼠成骨細胞分化中的功能和概況知之甚少。本研究中,研究人員分析了從新生小鼠顱骨前成骨細胞樣細胞以兩天為間隔獲得的18天的RNA測序(RNA-Seq)數據集。

        在成骨細胞分化過程中, 4058個mRNA和3948個lncRNA差異表達,根據模糊c均值聚類的表達模式將它們分為12個聚類。使用加權基因共表達網絡分析,研究人員確定了9個與早期分化階段(第2-8天)相關的模塊和7個與晚期分化階段(第10-18天)相關的模塊。基因本體論和KEGG途徑富集分析顯示,在晚期分化階段上調的mRNA和lncRNA與骨生成高度相關。最火,研究人員還鑒定了72個mRNA和89個lncRNAs作為潛在的標記物,包括用於成骨細胞分化和活化的幾種新標記物。

        綜上所述,該研究為小鼠lncRNA研究提供了有價值的實驗基礎,並提高了我們對小鼠成骨細胞分化生物學的理解。

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