在孤獨症譜係障礙兒童中，染色體微陣列分析與全外顯子組測序的分子診斷陽性率
克裏斯蒂娜·塔姆米麥斯(Tammimies)等加拿大安大略省多倫多市病童醫院遺傳學與基因組生物學項目應用基因組學中心等
意義 關於采用全基因組檢測對自閉症譜係障礙(ASD)個體進行分子診斷，尚需要進行更多的研究。
目的 在一個罹患ASD兒童的異質性群組中，進行染色體微陣列分析(CMA)和全外顯子組測序(WES)，以確定這些檢測在兒科發育診所典型樣本中的分子診斷陽性率。
設計、機構和參與者 該樣本包含258例連續、確診、相互無關的ASD兒童，這些兒童接受了詳細評估，以基於有嚴重先天性異常和輕微軀體異常來定義形態學評分。2008-2013年期間，在加拿大紐芬蘭省和拉布拉多省納入兒童。先證者被分層為形態學嚴重度遞增的3組：基礎型、中間型、複雜型(評分為0～3分、4～5分和≥6分)。
暴露 所有的先證者均接受CMA檢測，在95組先證者-父母三人組中進行WES檢測。
主要轉歸和測量指標 CMA和WES在一個基於人群、分為3個表型組ASD樣本中的所有分子診斷陽性率。
結果 在258例先證者中，有24例[9.3%，95%可信區間(CI)為6.1%～13.5%]接受了CMA檢測的分子診斷，95組中有8組(8.4%，95%CI為3.7%～15.9%)接受WES檢測的分子診斷。在不同的形態學組間，診斷陽性率存在統計學差異。在接受了CMA與WES兩項檢測的兒童中，存在可辨別的遺傳性病因學兒童的估算比例為15.8%(95%CI為9.1%～24.7%，15/95例兒童)。其中包括2例接受來自兩種檢測的分子診斷兒童。複雜型組的聯合診斷陽性率明顯高於基礎型組(成對比較的P值為0.002)。
結論和相關性 在這組ASD兒童的異質性樣本中，CMA和WES的分子診斷陽性率具有可比性，較為複雜形態學表型兒童中的聯合分子診斷陽性率高於基礎型兒童。如果這些結果能在其他人群得到複製，則有可能為ASD受累兒童分子診斷檢查的適當選擇提供信息。
[JAMA2015，314(9):89-903.doi:10.1001/jama.2015.10078]
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