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華人科學家揭示2019-nCoV的潛在T細胞和B細胞表位

作者：佚名來源：生物穀日期：2020-02-26

導讀

截至2020年2月26日，2019-nCoV已經感染了超過26個國家的超過77000人，奪走了超過2000條生命。2019-nCoV是一種引起COVID-19的新型冠狀病毒，與SARS-CoV有很高的相似性。目前還沒有針對2019-nCoV或任何形式的冠狀病毒的疫苗被批準。

關鍵字： 2019-nCoV

近日來自斯坦福大學醫學院的Chen Binbin和Ethan Fast在預印本網站bioRxiv上發表了一篇尚未經過同行評議的最新文章，題為"Potential T-cell and B-cell Epitopes of 2019-nCoV"。在該文章中，，研究人員使用來自結構生物學和機器學習的計算工具來識別基於病毒蛋白抗原和抗體結合特性的2019-nCoV 的T細胞和B細胞表位。這些表位可用於開發更有效的疫苗和鑒定中和抗體。

研究人員在人類MHC-I和MHC-II等位基因中鑒定了405個抗原表達分數良好的病毒肽，並在2019-nCoV S蛋白受體結合域附近發現了兩個潛在的中和性B細胞表位(440-460和494-506)。通過分析來自四大洲的68個病毒基因組的突變譜，研究人員發現了96個編碼突變。這些突變更可能發生在MHC-I表現評分較好的區域(p=0.02)。在S蛋白受體結合區附近不存在突變。最後，研究人員用SARS-CoV實驗數據來驗證了我們的計算方法。